根据《房产税暂行条例》第二条规定，房产税由产权所有人缴纳。产权未确定的，由房产代管人或者使用人缴纳。贵公司在村土地上建造的厂房，如果有证据证明该厂房的产权属于村委会，那么应由村委会为房产税的纳税人。否则，该房产的房产税纳税人则为贵公司。